Институт был создан в 1934 году на базе Лаборатории эволюционной морфологии, основанной известным россииским ученым академиком Алексеем Николаевичем Северцовым. После ряда преобразований и переименований в 1967 году Институту был дано название Институт эволюционной морфологии и экологии животных имени А.Н. Северцова (ИЭМЭЖ). В 1994 году вследствие концентрации фундаментальных исследовании на проблемах экологии, эволюции и биоразнообразия Институт был переименован и получил свое современное название. В Институте изучают проблемы общей и частной экологии животных, биоразнообразия, поведения и эволюционной морфологии животных, разрабатывают рекомендации по охране природы.
Основные направления исследований:
Структурно-функциональная организация, динамика и эволюция популяций, сообществ и экосистем.
Экология организмов и механизмы адаптаций.
Экологические и эволюционные аспекты поведения и коммуникации животных.
Морфологические закономерности и механизмы эволюции животных.
Биологическое разнообразие и устойчивое (рациональное) использование биологических ресурсов.
Фундаментальные проблемы охраны живой природы.
Биоповреждения, сертификационные испытания техники и материалов на климатическую стойкость и сохраняемость; эколого-аналитический контроль экотоксикантов в объектах окружающей среды.
