Научный Центр здоровья детей является самостоятельной научной медицинской организацией, имеющей статус государственного учреждения, и находится в непосредственном подчинении у Российской Академии медицинских наук, входя в состав отделения клинической медицины РАМН В настоящее время в составе Научного Центра здоровья детей РАМН функционируют:
НИИ педиатрии,
НИИ гигиены и охраны здоровья детей и подростков,
Консультативно-диагностический центр для детей
Отдел социальной педиатрии
Научно-организационный отдел,
Отдел международных научных связей
Отдел аспирантуры и ординатуры
Межведомственный Научный Совет по педиатрии РАМН и МЗ РФ
Федеральные научно-методические и практические центры:
Центр медико-социальных проблем подросткового возраста
